Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt33aQ8K0Y2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt33aQ8K0Y2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33aQ8K0Y2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33aQ8K0Y2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33aQ8K0Y2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33aQ8K0Y2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt33aQ8K0Y2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33aQ8K0Y2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33aQ8K0Y2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33aQ8K0Y2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33aQ8K0Y2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt33aQ8K0Y2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms