Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms