Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam20aQ8CID3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam20aQ8CID3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms