Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fbxo4Q8CHQ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fbxo4Q8CHQ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fbxo4Q8CHQ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fbxo4Q8CHQ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fbxo4Q8CHQ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fbxo4Q8CHQ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fbxo4Q8CHQ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms