Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rab11fip3Q8CHD8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab11fip3Q8CHD8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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