Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbm28Q8CGC6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm28Q8CGC6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm28Q8CGC6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm28Q8CGC6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm28Q8CGC6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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