Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Setd1bQ8CFT2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Setd1bQ8CFT2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Setd1bQ8CFT2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Setd1bQ8CFT2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Setd1bQ8CFT2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Setd1bQ8CFT2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Setd1bQ8CFT2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Setd1bQ8CFT2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Setd1bQ8CFT2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Setd1bQ8CFT2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Setd1bQ8CFT2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Setd1bQ8CFT2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Setd1bQ8CFT2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms