Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpf1Q8CFE2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hpf1Q8CFE2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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