Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm9955Q8CEJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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