Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc28aQ8CEI3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc28aQ8CEI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms