Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup88Q8CEC0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nup88Q8CEC0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup88Q8CEC0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms