Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc17Q8CE13 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc17Q8CE13 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms