Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc38Q8CDN8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc38Q8CDN8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc38Q8CDN8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms