Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atad2Q8CDM1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atad2Q8CDM1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms