Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrebrfQ8CDG5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CrebrfQ8CDG5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrebrfQ8CDG5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms