Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
6030452D12RikQ8CD33 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms