Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RybpQ8CCI5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RybpQ8CCI5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RybpQ8CCI5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms