Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlrc3Q8CCH2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc3Q8CCH2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms