Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slfn5Q8CBA2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slfn5Q8CBA2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms