Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo48Q8CAT8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms