Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc5Q8CAL5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc5Q8CAL5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc5Q8CAL5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms