Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Podxl2Q8CAE9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Podxl2Q8CAE9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Podxl2Q8CAE9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms