Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg4aQ8C9S8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atg4aQ8C9S8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4aQ8C9S8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
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