Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Spef2Q8C9J3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Spef2Q8C9J3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms