Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7M3

Trim9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim9Q8C7M3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim9Q8C7M3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim9Q8C7M3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim9Q8C7M3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim9Q8C7M3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms