Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csgalnact2Q8C1F4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact2Q8C1F4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms