Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gpcpd1Q8C0L9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpcpd1Q8C0L9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpcpd1Q8C0L9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms