Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg16l1Q8C0J2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg16l1Q8C0J2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms