Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccser1Q8C0C4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccser1Q8C0C4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser1Q8C0C4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms