Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx22Q8C084 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx22Q8C084 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx22Q8C084 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx22Q8C084 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx22Q8C084 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx22Q8C084 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms