Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc169Q8BXX9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc169Q8BXX9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc169Q8BXX9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms