Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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Trerf1Q8BXJ2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Trerf1Q8BXJ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Trerf1Q8BXJ2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Trerf1Q8BXJ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trerf1Q8BXJ2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trerf1Q8BXJ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trerf1Q8BXJ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trerf1Q8BXJ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trerf1Q8BXJ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trerf1Q8BXJ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trerf1Q8BXJ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trerf1Q8BXJ2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trerf1Q8BXJ2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trerf1Q8BXJ2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Trerf1Q8BXJ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
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Trerf1Q8BXJ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Trerf1Q8BXJ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trerf1Q8BXJ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Trerf1Q8BXJ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Trerf1Q8BXJ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Trerf1Q8BXJ2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Trerf1Q8BXJ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Trerf1Q8BXJ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trerf1Q8BXJ2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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