Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Actrt3Q8BXF8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms