Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctdsp2Q8BX07 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ctdsp2Q8BX07 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Ctdsp2Q8BX07 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ctdsp2Q8BX07 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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