Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Kdm4aQ8BW72 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kdm4aQ8BW72 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm4aQ8BW72 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kdm4aQ8BW72 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kdm4aQ8BW72 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm4aQ8BW72 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm4aQ8BW72 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm4aQ8BW72 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm4aQ8BW72 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms