Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fbxo38Q8BMI0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo38Q8BMI0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms