Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hirip3Q8BLH7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hirip3Q8BLH7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hirip3Q8BLH7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms