Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan9Q8BJU2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan9Q8BJU2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tspan9Q8BJU2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms