Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcal1Q8BJL0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcal1Q8BJL0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smarcal1Q8BJL0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcal1Q8BJL0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcal1Q8BJL0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcal1Q8BJL0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcal1Q8BJL0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcal1Q8BJL0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcal1Q8BJL0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcal1Q8BJL0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms