Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prune1Q8BIW1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prune1Q8BIW1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prune1Q8BIW1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms