Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdca8Q8BHX3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdca8Q8BHX3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdca8Q8BHX3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms