Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH88

Depdc1b, DEP domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc1bQ8BH88 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Depdc1bQ8BH88 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc1bQ8BH88 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc1bQ8BH88 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms