Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW8

Vgll2, Transcription cofactor vestigial-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll2Q8BGW8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vgll2Q8BGW8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vgll2Q8BGW8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vgll2Q8BGW8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vgll2Q8BGW8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vgll2Q8BGW8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms