Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp4f39Q8BGU0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp4f39Q8BGU0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms