Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim6Q8BGE7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim6Q8BGE7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim6Q8BGE7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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