Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Htatsf1Q8BGC0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Htatsf1Q8BGC0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Htatsf1Q8BGC0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Htatsf1Q8BGC0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Htatsf1Q8BGC0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Htatsf1Q8BGC0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Htatsf1Q8BGC0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Htatsf1Q8BGC0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Htatsf1Q8BGC0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Htatsf1Q8BGC0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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