Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg4cQ811C2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg4cQ811C2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg4cQ811C2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms