Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NfascQ810U3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NfascQ810U3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfascQ810U3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms