Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc172Q810N9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc172Q810N9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc172Q810N9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc172Q810N9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms