Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZW0

Stk35, Serine/threonine-protein kinase 35, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk35Q80ZW0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stk35Q80ZW0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stk35Q80ZW0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stk35Q80ZW0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stk35Q80ZW0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stk35Q80ZW0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Stk35Q80ZW0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms